DAP-Seq
- 高通量
- 無需抗體
- 靈活可控
- 物種普適性廣
服務特色
DAP-seq（DNA親和純化測序）技術的核心優勢在于其無需體內實驗便可高效解析轉錄因子結合位點。它通過將體外表達的轉錄因子與基因組DNA文庫共孵育，結合高通量測序，直接、全局性地繪制全基因組范圍內的蛋白結合圖譜。該方法繞過了復雜的轉基因操作，尤其適用于研究難以在體內操作的轉錄因子，具有通量高、周期短、不受內源干擾的顯著優勢，是挖掘基因調控網絡的有力工具。有力工具。
服務介紹
DAP-Seq是一種用于鑒定轉錄因子結合位點的高通量測序技術，通過體外表達帶有親和標簽的轉錄因子，與基因組DNA文庫孵育，使轉錄因子特異性結合DNA片段，再利用親和純化技術捕獲結合的DNA，最后通過高通量測序確定轉錄因子的結合位點。
服務優勢
- 無需抗體/轉基因：規避物種限制，尤其適合非模式植物。
- 高效低成本：體外表達周期短，通量高。
- 保留表觀印記：可使用天然gDNA（含甲基化等修飾）。
- 靈活可控：可人為添加輔因子，模擬特定生理環境。
- 與ChIP-seq對比：DAP-seq適用范圍擴展至數百種缺乏遺傳工具的植物物種。
服務流程
客戶提供
樣本量：柔軟組織3g-5g；木本科植物的樹根、樹皮、樹枝等10g-20g；
果實、種子10g-20g；花序、花蕊、花粉2g-3g。
樣本處理：樣本采集時如果植物組織表面污漬較多，應迅速用預冷的RNase-free水或75%乙醇擦拭或沖洗干凈，再用吸水紙吸干植物表面殘留液體，液氮速凍，-80℃保存，干冰寄送。
最終交付
- 結題報告及原始數據
- 測序數據質量評估，過濾掉質量數據，保證數據質量
- Peak?在?TSS?附近的分布
- Peak?在染色體上的分布 Peak?在基因組功能區的分布
- Peak?相關基因的?Gene Ontology?富集分析
- Peak?相關基因的?KEGG?富集分析
- 富集區間?Motif?分析
服務說明
| 產品 | 測序數據量 | 平臺 |
周期（工作日，提取+測序分析） |
備注 |
| DAP-seq | 8G | Illumina |
50 |
每組實驗包含兩個技術重復和一個input |
案例分析
文獻來源：Yang C, et al. GmMYB4 Positively Regulates Isoflavone Biosynthesis via the GmMAPK6-GmMYB4-MBW Module in Soybean. Plant Biotechnol J. 2025 Oct 25.
MYB 轉錄因子 （TF） 是大豆中異黃酮生物合成的關鍵調節因子，但其調節功能的確切機制仍知之甚少，通過全基因組關聯研究和功能表征確定了 GmMYB4 是異黃酮積累的關鍵正調節因子。為了闡明 GmMYB4 介導的調控的分子機制，結合 DAP-seq 和 RNA-seq 數據集進行綜合分析，確定了1477個基因作為其潛在的直接靶標。KEGG通路富集分析顯示這些基因顯著富集于類黃酮生物合成通路，包括編碼查爾酮合成酶、黃烷酮-羥化酶和黃烷醇合成酶的關鍵基因。證明了GmMYB是作為控制大豆中類黃酮和原花青素生物合成和積累的關鍵轉錄調節因子。
DAP-seq和RNA-seq技術聯合對GmMYB4結合位點和靶基因進行全基因組分析
